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全基因組甲基因測序
來源：萬物生物 發(fā)布時間：2021-11-02
全基因組DNA甲基化測序
全基因組DNA甲基化測序（Whole Genome Bisulfite Sequencing，WGBS）是將重亞硫酸鹽處理方法和Illumina高通量測序平臺相結(jié)合，對有參考基因組的物種在全基因組水平進行高精準(zhǔn)甲基化研究。WGBS可以達到單堿基分辨率，精確分析每一個胞嘧啶的甲基化狀態(tài)，從而構(gòu)建精細的全基因組DNA甲基化圖譜。
基于全基因組重亞硫酸鹽轉(zhuǎn)化的WGBS法，實現(xiàn)單堿基分辨率的甲基化位點精準(zhǔn)、高效定位。精準(zhǔn)獲得全基因組甲基化的C位點，是甲基化測序的金標(biāo)準(zhǔn)；全面分析不同處理對全基因組甲基化水平的影響，快速準(zhǔn)確地找到差異甲基化區(qū)域。具有“高效、精準(zhǔn)、超值”的優(yōu)勢，已廣泛應(yīng)用于人和動植物研究。
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WGBS |
分析內(nèi)容 |
解決問題 |
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標(biāo)準(zhǔn)分析 |
測序數(shù)據(jù)質(zhì)量評估 |
過濾掉低質(zhì)量數(shù)據(jù)，保證數(shù)據(jù)質(zhì)量 |
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與參考基因組比對 |
比對率和覆蓋度分析 |
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甲基化位點calling |
分析甲基化位點 |
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甲基化分布 |
甲基化在基因組，染色體，功能元件上的分布 |
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差異甲基化分析 |
尋找DMR |
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相關(guān)基因分析 |
相關(guān)基因GO，KEGG富集分析 |
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多樣本分析 |
PCA分析多樣本甲基化變化規(guī)律 |
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標(biāo)書基金實驗咨詢 表觀遺傳組學(xué)分析
課題實驗結(jié)題指導(dǎo) 細胞分子功能驗證
實驗培訓(xùn)文章潤色 動物模型裸鼠成瘤
臨床檢測科研轉(zhuǎn)化 病理染色分子互作